En el área de salud y sanidad animal de Zoológico Nacional, laboran médicos veterinarios capacitados para realizar procedimientos de medicina curativa y preventiva, de acuerdo a los estándares de la AZA.  Nuestra clínica veterinaria se encuentra debidamente equipada para la realización de procedimientos clínicos y de medicina preventiva, y debido a su basta experiencia, se ha constituido como  un referente permanente  para otras instituciones a nivel nacional. Dentro del trabajo en medicina preventiva, se encuentra la Sala de Crianza, en donde se albergan animales rechazados por sus padres, animales en tratamiento médico y animales en tránsito, ya sea por remodelación de sus recintos o animales decomisados o dañados que el Zoológico Nacional recibe de forma temporal. Los programas de medicina preventiva contemplan la ejecución de exámenes clínicos y toma de muestras para todas las especies existentes.  Esto permite adelantarse a la aparición de enfermedades infecciosas y realizar recomendaciones respecto a la alimentación y exhibición de los animales.  Los controles preventivos han sido realizados adecuadamente y por lo tanto se tiene una idea real de la condición sanitaria de las especies residentes.